腰椎間盤突出症治療方法的選擇取決於疾病的不同病理階段和臨牀表現，病人的身體、心理及經濟狀況。主要分爲保守治療、手術治療和微創治療。
1、保守治療：適用於初次發病，病程較短，症狀體徵較輕，影像學檢查顯示椎間盤突出較小或年老體弱、伴有全身疾病或局部皮膚病，不能施行手術治療者。常用的方法有：臥牀休息；藥物治療（口服布洛芬緩釋膠囊等西藥或中藥，中西藥膏外敷）；牽引療法；物理療法（低頻、中頻、高頻電療法，紫外線、紅外線療法，石蠟療法等）；推拿、按摩療法；鍼灸療法；封閉療法；針刀療法。
2、手術治療：包括硬膜外腰椎間盤切除術、椎板開窗減壓術、半/全椎板切除術、單側椎板並關節切除術、椎間孔開窗術、黃韌帶切除術、脊柱內鏡顯微椎間盤切除術、人工椎間盤置換術、人工髓核植入術、脊柱/腰椎融合術等。手術療法適用於病史超過半年，保守治療無效，症狀加重，影像學檢查顯示髓核突出大或遊離至椎管內，伴有明顯黃韌帶肥厚或骨性椎管狹窄，椎間孔內或極外側型腰椎間盤突出。手術治療療效好，但創傷較大，住院時間長，費用也高。
3、介入治療：近年來，隨着影像設備及現代技術的發展，腰椎間盤突出症的介入微創治療日益受到廣大患者和醫務工作者的喜愛。目前已廣泛開展的有：經皮穿刺椎間盤髓核切吸術、激光髓核氣化減壓術、膠原酶溶解術、低溫等離子髓核消融術、射頻消融術和臭氧溶核術等介入治療。這種治療不用開刀，僅用一根細針即可以達到和手術治癒率接近的良好效果。介入治療方法適用於1到3周以上嚴格保守治療無效或手術治療再度復發者；對於以下情況屬於絕對禁忌：對碘和膠原酶有過敏反應者；14歲以下兒童；患嚴重心血管疾病、肝腎功能障礙或精神不正常，不能配合手術者；腰部有感染病竈或創面者。以下情況要具體對待:同一椎間隙既往有外科或經皮微創手術史；兼有椎管狹窄、側隱窩狹窄等其它腰椎疾患或已有腰椎不穩者；多發性腰椎退行性病變或多節段椎間盤突出且症狀不典型和定位不明確者；影像顯示椎間盤後突入椎管，佔位50%以上的巨大型突出、椎間盤鈣化或椎間隙明顯狹窄、椎間盤突出壞死型；病人已發生足下垂、肌萎縮等嚴重神經障礙或膀胱直腸功能障礙者。