治療慢性胃炎用藥，一須注意“靈通”，二須注意“升降”；三要在辨證用藥時，注意結合辨病用藥。因本病雖着重在於脾胃，而實與肝鬱氣滯血瘀有關。本病常見食後飽脹、噯氣、泛惡、胃痛等症狀，如果用藥不注意輕靈流通，則可使症狀加重。因此，雖見脾胃氣虛而用黨蔘、黃芪、白朮、甘草之類以益氣健脾，也須用陳皮、半夏、木香之屬以理氣和胃；雖見胃陰虧虛而用石斛、麥冬、沙蔘等品以清養胃陰，亦當佐以川楝子、綠萼梅、佛手等藥疏肝醒胃。同時在選擇靈通之藥中，要善於運用活血化瘀之藥，丹蔘、赤芍可以優先選用。莪術、紅花亦有良好療效。其次，由於脾氣宜升，胃氣宜降，如果脾之清氣不升，則見中滿腹脹，泄瀉；胃之濁氣不降，則見嘔吐、泛酸、噯氣。升提之藥常與益氣藥同用，如升麻、柴胡、黨蔘、黃芪、枳實等。枳實具有苦降破氣作用，《神農本草經》認爲枳實能“長肌肉，利五臟，益氣，輕身”，可見本品確有補氣升清的作用。枳實用於補氣升清，可與參、芪、升、柴相配；用於破氣降氣，可與青皮、降香、厚朴、川楝子相配。和降藥常與瀉肝藥同用，如旋覆花、代赭石、川連、左金丸等。偏寒者加生薑、紫蘇；偏熱者加竹茹、杷葉。在用升提或和降藥中，均可配伍白芍，柔養以制肝木之旺，有很好的緩急止痛作用。
在辨證用藥的同時，還須注意辨病用藥。本病常兼肝失疏泄，可以影響胃液的正常分泌。如胃酸過多，可選用煅瓦楞、煅烏賊骨以制酸；如胃酸減少或缺失，可選用山楂、烏梅、木瓜等以助酸。膽汁反流性胃炎，常因肝失疏泄，使膽汁的正常排泄受到障礙，導致膽汁鬱遏而返流，可以選用柴胡、鬱金等疏肝利膽。慢性萎縮性胃炎，如見腸腺上皮化生，可選用八月札、生薏苡仁、莪術等，以防癌變。一般認爲莪術破血祛瘀作用較峻，其實藥性平和，本品含芳香揮發油，能直接興奮胃腸道，有很好的健胃作用，化瘀消痞，止痛作用頗佳，在治療慢性胃炎中，可以配合一些清熱藥，蒲公英最爲合適，清熱而不苦寒，且有健胃作用。