一、實驗室檢查
1.血清酶學檢查
(1)ALT、AST：一般爲輕度升高，達正常上限的2～3倍。酒精性脂肪肝的AST升高明顯，AST/ALT>2有診斷意義。非酒精性脂肪肝時則ALT/AST>1。ALT>130U，提示肝小葉脂肪浸潤明顯，ALT持續增高提示有脂肪性肉芽腫。
(2)γ-GT、ALP：酒精性脂肪肝時γ-GT升高較常見，ALP也可見升高，達正常上限的2倍;非酒精性脂肪肝患者γ-GT可以升高。
(3)GST：可反映應激性肝損傷，較ALT更敏感。
(4)穀氨酸脫氫酶(GDH)、鳥氨酸氨甲酰轉移酶(DCT)。GDH爲線粒體酶，主要在肝腺泡Ⅲ帶富有活性，DCT爲尿素合成酶，參與轉甲基反應。脂肪肝時兩酶都升高。尤其是酒精性脂肪肝，其GDH/OCT>0.6。
(5)膽鹼酯酶(CHE)、卵磷脂膽固醇酰基轉移酶(LCAT)：80%脂肪肝血清CHE和LCAH升高，但低營養狀態的酒精性脂肪肝升高不明顯。CHE對鑑別肥胖性脂肪肝有一定意義。
2.血漿蛋白變化
(1)β球蛋白，α1、α2、β脂蛋白多升高。
(2)白蛋白多正常。
(3)肥胖性脂肪肝時，LDL-C升高，HDL-C顯著降低，Apo B，Apo E，Apo CⅡ和Ⅲ升高。
3.血漿脂類 TG、FA、膽固醇、磷脂常升高，其中膽固醇升高顯著，常>13mmol/L。
4.色素排泄試驗 BSP、ICG排泄減少。在肥胖性和酒精性脂肪肝時，因爲脂肪貯積多在肝腺泡Ⅲ帶，而色素處理也在此部位。肝臟脂肪貯積影響了肝細胞排泄色素的功能。排泄減少的程度與肝臟脂肪浸潤程度有關。
5.膽紅素 嚴重脂肪肝時可有血膽紅素升高，輕中度脂肪肝膽紅素多正常。
6.凝血酶原時間(PT) 非酒精性脂肪肝多正常，部分可延長。
7.血胰島素水平呈高反應延遲型，糖耐量曲線高峯上升，下降延遲。
8.血尿素氮、尿酸偶見升高。
二、輔助檢查
1.B超檢查 瀰漫性脂肪肝的超聲波圖像主要表現爲回聲波衰減，按其衰減的程度，脂肪肝可分爲3種：
(1)輕度脂肪肝：表現爲近場回聲增強，遠場回聲衰減不明顯，肝內管狀結構仍可見。
(2)中度脂肪肝：前場回聲增強，後場回聲衰減，管狀結構模糊。
(3)重度脂肪肝：近場回聲顯著增強，遠場回聲明顯衰減，管狀結構不清，無法辨認。超聲對重度脂肪肝的靈敏度達95%。
2.CT檢查 脂肪肝CT圖像與實時超聲(US)圖像表現不同。CT診斷的準確性優於B超，主要表現爲肝密度普遍或侷限性降低，甚至低於脾及肝內血管密度，而相比之下，門靜脈內回聲增強，密度降低與脂肪化嚴重程度相一致。動態的CT變化可反映肝內脂肪浸潤的增減。瀰漫性脂肪肝在CT上表現爲肝的密度普遍低於脾臟和肝內血管密度;重度脂肪肝時，肝臟CT值可降至10Hu左右(正常肝的密度比脾臟高6～12Hu)。增強後CT掃描，脂肪肝的肝內血管影顯示得非常清楚，其形態、走向均無異常，有時血管可變細、變窄，但無推移、包繞現象，有助於鑑別肝癌與脂肪肝內的竈性非累及區(正常“肝島”)。
3.MRI檢查 一般認爲其價值較US和CT爲小。脂肪肝的磁共振(MRI)表現爲全肝、一葉或竈性脂肪浸潤，自旋迴波(SE)序列和反轉恢復(IR)脈動序列的T1加權信號正常。短的IR序列和SE的T2加權像信號可稍高，但只顯示脂肪的質子像;脂肪浸潤區爲高信號，肝內血管位置正常。近年有人用MRI測定肝組織脂肪含量。
4.肝活檢 是確診脂肪肝的重要方法，尤其對侷限性脂肪肝。在B超引導下抽吸肝組織活檢遠較過去盲目肝穿刺法準確、安全。活檢的意義在於確定肝內是否存在脂肪浸潤，有無纖?
(1)局竈性脂肪肝或瀰漫性脂肪肝伴正常肝島難以與惡性腫瘤區別，需要在B超引導下進行肝活檢。(2)探明某些少見的脂肪性肝疾患的病因，如膽固醇酯貯積病、糖原累積病、Wilson病等。
(3)無症狀性可疑的非酒精性脂肪性肝炎，肝活檢是惟一的確診手段。
(4)戒酒和酒精性肝病或酒精性肝病有不能解釋的臨牀或生化異常表現者，以及酒精性肝炎考慮皮質類固醇治療前需肝活檢排除活動性感染。
(5)肥胖性脂肪肝患者減少原有體重的10%後，肝功能酶學仍持續異常者，需肝活檢尋找其他原因。
(6)懷疑重症肝炎系脂肪肝所致，需肝活檢明確診斷並瞭解其病因者。
(7)評估某些血清學指標以及B超、CT等影像學檢查診斷脂肪肝、纖維化的可靠性，需以肝活組織學改變作爲金標準，並用以客觀評價某一治療方案對脂肪肝纖維化治療的確切效果。
(8)任何懷疑不是單純性肝細胞脂肪變或懷疑多種病因引起的脂肪肝或肝功能損害者，需通過肝活檢明確其具體病因或以何種病因爲主。