在剛見到新生兒的瞬間，母親抱起嬰兒，並將嬰兒緊貼身子摟抱。父親也應有機會分享這一時刻。新生兒生後12小時內應進行全面體格檢查，包括通過體格和神經肌肉檢查更準確地判斷胎齡。
測量 身長的測量是從頭頂到足跟，頭圍(耳上最大的測得值)大約應是身長的一半加10cm。圖260-1顯示了出生體重和胎齡分類之間的關係。足月兒的平均體重是3。2kg。測得的新生兒的大小與相應的胎齡對比，可能對一些情況提供重要的線索。例如，如果嬰兒小於胎齡，可能是由於宮內感染或染色體畸形所引起。而若嬰兒大於胎齡，可能是因爲母親患糖尿病或高胰島素血癥，如Beck-with綜合徵，由於大血管錯位引起的發紺型先天性心臟病，母親肥胖症或家庭的素質如在Crow和Cheyenne地區的印第安人。
心肺系統 正常情況下，呼吸爲腹式呼吸，呼吸頻率40~50次/分，呼吸音粗但整個胸部的聽診音相同。用聽診器可聽到心音，胸骨下端最清楚。心率100~150次/分(平均120次)，可有明顯的竇性心律不齊。常可聽到心臟雜音，但其中大約只有10%與先天性心臟病有關。有嚴重的先天性心臟疾病的新生兒，例如大動脈閉鎖，右或左心室發育不全，可表現出蒼白或心力衰竭。
可捫及股動脈搏動，檢查時兩側同時進行，比較他們的搏動強度。若股動脈搏動微弱，可能存在主動脈閉鎖或左心室畸形。股動脈搏動微弱時應用多普勒血壓計(如DOPTONE裝置)測定所有肢體來加以確定。多普勒血壓計是用一個裝在充氣膨脹的袖帶上的超聲傳感器，探測放氣時血管中的涌流，從而精確地測定收縮壓和舒張壓。此外，轉紅試驗也可用於測定血壓。擡高肢體直到皮膚變蒼白，使血流排盡，然後對事先綁好的血壓袖帶像常規測量血壓一樣充氣，將肢體置於病兒一側，逐漸降低袖帶的壓力，當肢體顏色轉紅時記下讀數(這代表收縮壓)。
肌肉骨骼系統 肢體應該對稱且能自主活動。新生兒仰臥，髖關節和膝關節屈曲時，股部能完全外展到檢查桌平面。外展受限，且當股骨頭滑入髖臼時可摸及彈響聲，是先天性髖關節脫位的主要體徵。女嬰和臀位產嬰兒特別容易發生髓關節脫位。若髖關節活動受限，應作超聲檢查並請矯形外科專家會診。極輕微的先天性髖關節發育不良，可用兩塊或三塊尿布兜起來，這種方法很適用。
比較嚴重的病例，可以由矯形外科醫生在超聲觀察檢查下應用外展夾板治療。若不能馬上請矯形專家治療，可每天24小時應用三塊尿布兜起，一直到能使用夾板時爲止。假如用任意形狀的尿布，第一塊尿布應緊貼皮膚包緊，另兩塊作爲外層，一起形成較大的體積。如果有畸形足或任何其他明顯的需矯形的畸形存在，應立即開始治療。
神經系統 應引出Moro反射，吸吮反射和覓食反射。正常情況下，深部腱反射應存在並兩側對稱。
皮膚 皮膚通常是紅潤的，但在生後最初幾小時常出現手足發紺。幾天後發生乾燥，蛻皮，尤其是足踝和手腕皺褶處。因爲分娩時受產道擠壓，頭位娩出的嬰兒在頭面部可見到瘀斑，但若見於臍以下部位皮膚時，則表示有異常。在妊娠24周以後，新生兒體表大多覆蓋一層胎脂，妊娠40周後逐漸消失。
頭部 頭位產時頭部可變形，有顱縫重疊和頭皮水腫和/或瘀斑(產瘤)。臀位產時，頭部通常不變形，水腫，瘀斑出現在先露部位(如臀，生殖器或足)。囟門直徑變化從指尖至幾個釐米。頭顱血腫是血液聚集在骨和骨膜之間而產生的一個不超過骨縫的腫脹。可發生於一側或兩側頂骨，偶見於枕骨。頭顱血腫通常在生後最初幾小時，水腫消失前不明顯，幾個月後才逐漸消失，不必抽吸。
由於宮內胎位影響可能會出現面部不對稱。但當嬰兒啼哭時有鼻脣溝和眼周皺紋不對稱，應疑及面神經癱瘓。
眼睛睜開時兩眼應對稱，瞳孔等大，有對光反應，眼底清晰可見。如果以直接檢眼鏡檢查有紅光反射，可排除玻璃體混濁。鞏膜出血是常見的。
耳朵的檢查可確定胎齡，尚須檢查耳朵的位置;耳位低常標誌有腎臟或遺傳性疾病。耳道應該是張開的並可看得見鼓膜。廉價手提式聽力測定器雖可測試新生兒聽力，但在總體篩查中，其可靠性和有效性尚待證實。腦幹聽覺誘發反應的測試可應用於高危病人，應該仔細詢問有無家族性耳聾病史，胎兒期風疹，新生兒黃疸或母親或新生兒曾否接受氨基糖苷類抗生素治療。
口腔應檢查上齶和懸雍垂完整與否，有無牙齦囊腫和先天性舌繫帶過短(舌繫帶短縮)。在硬齶上出現小珠樣隆起(Epstein小結)和小潰瘍(Bednar口瘡)是正常的。另外還需檢查嬰兒的吸吮能力。
腹部 由於10%的新生兒可有腹部畸形，需要在生後頭幾天內仔細觀察，包括腎臟和其他器官形狀，大小或位置的異常。正常情況下，肝臟在肋緣下1~2cm處可觸及，脾尖很容易被觸及。一般兩側腎臟均可觸及，左側比右側更容易觸及，若不能觸及腎臟，可能存在腎缺失或發育不全。巨大腎可能由梗阻，腫瘤或囊性病變引起。男嬰不能排尿提示有後尿道瓣。由於臍周圍肌肉系統薄弱，臍疝很常見，但很少引起症狀，或需要治療。
生殖器 足月男嬰的睾丸應在陰囊內，新生兒常發生鞘膜積液和腹股溝疝。一個硬的變色的陰囊腫塊可能是睾丸扭轉，尤其是臀位產時。雖然睾丸扭轉很少見且在新生兒期疼痛不明顯，但屬外科急診。如扭轉存在，通過斑痕的分佈和睾丸的硬度可鑑別睾丸扭轉還是單純性挫傷。若是鞘膜積液，腫塊是透光的。女嬰陰脣突出，可出現暫時性和非刺激性的粘液，偶爾呈血性的分泌物(假月經)，然而如有血塊時應加以檢查。陰脣繫帶後可見一小腫物，認爲是母親激素刺激所致，幾周後即消失。
體重 對大多數新生兒來說，生後頭幾日體重喪失5%~7%是正常且常見的。胎糞(一種粘性的墨綠色的東西，含有來自於吞嚥的羊水中的胎毛和鱗狀上皮，以及腸分泌物)的排出，胎脂的脫落和臍帶的乾燥均可引起一些體重喪失，但大多是由於排尿和不顯性失水引起。
臍帶 塑料臍帶夾應在24小時去掉以免對乾燥的臍帶殘端造成過大的張力。每天用70%酒精塗擦臍帶殘端，以促進乾燥，減少感染。臍部是感染侵入的最佳途徑，是細菌殖民的第一個部位，因此應每日觀察臍部是否紅腫或有否滲出。臍部也常常是爲控制感染所選擇的細菌培養部位。
包皮 包皮環切一般都是應父母要求，很少有醫療上的指徵。在未經包皮環切的男嬰中尿路感染的發病率增加，常被某些人用來作爲包皮環切的指徵。包皮環切一般在生後頭幾天在局麻下實施。但若有尿道口移位，尿道下裂或任何其他的陰莖或龜頭畸形，應延遲手術。因爲包皮可在以後供作整形修補之用。如果有血友病或其他出血性疾病家族史存在，或母親使用影響凝血機制的長效藥物，如抗凝劑或阿司匹林，應禁止手術。
皮膚 中毒性紅斑，最常見的新生兒皮膚損害，是一種良性的自限性的皮膚紅斑，可發生在生後一週內的任何時間，但最多見於第二日。常見於與衣服摩擦的手臂，腿，背部，面部少見。皮疹呈紅斑狀，中間有丘疹，丘疹可能會相當突出，丘疹內容物塗片賴特染色可發現有嗜酸性細胞。對嚴重病例，應尋找家族過敏史。如有家族過敏史，應避免使用洗劑，粉劑，香皂和塑料。
皮下脂肪壞死可發生在任何容易受到創傷或壓迫的骨性凸起部位，尤其是頭，頰和頸等分娩時使用產鉗的部位。損害處堅硬，孤立，分界清楚。損害可能穿破皮膚表面，流出清亮黃色無菌液體，壞死處可自行消散或用壓力面圈(pressue-doughnut)包紮後消散。
正常新生兒可出現輕度黃疸，但若在生後24小時內出現或足月兒的血清膽紅素濃度>12mg/dl(>205μmol/L)應引起注意(對早產兒和其他一些情況下，膽紅素濃度在較低水平時就應予以重視。
排尿 新生兒排出的第一次尿是濃縮的，常含有尿酸鹽，能把尿布染成粉紅色。生後24小時內不排尿，應作全面徹底的檢查。延遲排尿在男嬰多見，可能與包莖以及剛做完包皮環切術後龜頭水腫和腫脹有關。
排糞 每一個嬰兒應在24小時內排出胎糞。但在出生時有胎糞污染的嬰兒可能會延遲排糞。延遲排糞最常見的原因是粘稠胎糞的栓塞。