1.導致肝硬化、肝癌
脂肪肝是肝臟脂質代謝失衡，導致脂質在肝臟內淤積，從而致使肝細胞無法進行正常的生理功能--變性、壞死，長期發展則形成肝纖維化、肝硬化，而肝硬化常繼發肝癌出現。
2.誘發高血脂、動脈粥樣硬化
肝臟出現脂肪淤積，脂類代謝失衡，那麼血液中甘油三酯就會升高，血黏稠度增加，就會促進動脈粥樣硬化的形成。
3.降低機體免疫力，以及加重腎臟解毒排毒負擔
衆所周知，肝臟、腎臟是人體兩大主要的解毒排毒器官，脂肪肝患者肝細胞變性、壞死，導致肝臟免疫功能下滑，“人體化工廠”出現動力受阻，解毒排毒能力下降，那麼解毒壓力自然會轉向腎臟，腎臟長期超負荷，常出現尿酸走高等腎臟疾病。
4.伴發膽道疾病
肝臟是分泌膽汁的重要器官，肝臟不好會影響到膽汁分泌及輸送，出現膽囊功能失衡。臨牀上約有20%~30%的脂肪肝患者伴隨膽結石、膽囊炎病症。
長期脂肪肝可誘發或加重高血壓、冠心病、動脈粥樣硬化等，一些有脂肪肝的肥胖者極易併發致命性的心腦血管病。同時在調查中發現，脂肪肝中合併糖尿病的爲30%~40%.輕度脂肪肝並不嚴重，但不及時治療，等脂肪肝惡化後，會引起很嚴重的後果。
5.誘發、加重糖尿病病症
肝臟負責人體三大營養物質的代謝--脂類、糖類、蛋白質。脂肪肝患者肝臟脂類代謝紊亂，會誘發加重糖類代理失調。2型糖尿病常胰島素分泌不足與胰島素抵抗相互促進，繼發受脂類代謝影響。