小兒腦癱合併症有如下幾種：
智力低下：
據報道，約有三分之二以上患兒智力落後，其中約５０％患兒有輕度至中度智力低下，約２５％爲重度智力低下。痙攣型四肢癱及強直型腦癱者智力常更差，手足徐動型患兒智力嚴重低下者極少。
視力障礙：
約半數以上患兒伴智力障礙，最常見者爲眼球內斜視和屈光不正，如近視、弱視等；少數有眼震，偶爾爲全盲；偏癱患兒可有同側偏盲。視覺缺陷可影響眼—手協調功能。
聽力障礙：
部分患兒聽力減退甚至全聾，以新生兒患高膽紅素血癥引起的手足徐動型患兒最爲常見。多數對高音頻的聽力喪失，需做出腦幹聽覺誘發電位測定才能被察覺。
其他感覺和認知異常：腦癱患兒常有觸覺、位置覺、實體覺、兩點判別覺缺失。患兒往往缺乏正確的視覺空間立體感覺，其認知功能缺陷較爲突出。因而，在康復醫院訓練中，對學習新的運動技巧和學習各種知識和活動，常常會發生某些困難。
語言障礙：
腦癱患兒的語言缺陷與出生前後大腦受損和受損後繼發大腦發育遲緩密切相關，也可因聽力缺陷等因素引起。據報道，約三分之一至三分之二患兒有不同程度的言語障礙。表現爲語言發育遲緩、發音困難、構音不清，不能成句說話，不能正確表達，有的患兒完全失語。手足徐動型和共濟失調型患兒常伴語言障礙；痙攣型四肢癱、雙側癱患兒也常伴語言障礙。
癲癇發作：
小兒腦癱合併癲癇的發生率文獻報道差異甚大，至少有四分之一到三分之一或四分之一以上的患兒在不同年齡階段出現癲癇發作，一痙攣型四肢癱、偏癱、單肢癱和伴有智能低下者更爲多見，手足徐動型、共濟失調型患兒則很少見。
口面、牙功能障礙：
有些腦癱患兒吸吮無力，吞嚥、咀嚼困難，口脣閉合不佳，經常流涎，有些患齲齒或牙齒髮育不全，這些症狀以手足徐動型患兒最多見。
情緒、行爲障礙：
大多數腦癱患兒有情緒或行爲異常，此與大腦功能受損有關。大量臨牀資料表明，大腦的邊緣系統（特別是海馬迴）受損時，可引起患兒情緒異常。患兒表現爲好哭、任性、固執、孤僻、脾氣古怪、情感脆弱、易於激動，有的有明朗幹、快活感、情緒不穩定等。這些症狀以手足徐動型患兒較爲常見。此外，多數腦癱患兒表現有活動過多，注意力分散，行爲散亂等。偶爾見患兒用手猛擊都不下頜等自身傷害的“強迫”行爲。
其他：多數患兒有體格發育落後，營養不良，嚴重運動障礙的嬰兒患者更爲常見，且因爲免疫力功能低下，常易患呼吸道感染性疾患等。多數患兒因身體運動、感覺、智能、語言、情緒、行爲等單項或多項缺陷，以致常有學習和社交困難。通常腦癱患兒的運動障礙與上述並存的相關缺陷相互影響。例如，聽覺、智能障礙加重言語障礙，各種感覺、認知障礙、癲癇發作、學習困難等又加重智能障礙。這些因素的疊加影響，是腦癱患兒的康復訓練很困難。
