（1）兒童肥胖性脂肪肝難以糾正的原因首先與家庭的遺傳基因有關。大量研究發現：父母有一方肥胖的，其子女肥胖的可能性爲32%~34%；父母雙方均肥胖的，其子女肥胖的發生率可高達50%~60%。從反向調查發現：72%的胖孩子的父母中至少有一人也肥胖，目前已經找到了多種與肥胖有關的遺傳基因。
（2）其次是目前生活水平明顯提高，父母對獨生子女過分偏愛，目前孩子們往往大量偏吃高脂肪飲食，甜食，尤其是無限制地吃零食，喝甜飲料，進食過多，營養過剩，已使中國脂肪肝人羣超過6000萬，而且衆多的肥胖兒童已經成爲脂肪肝隊伍中的生力軍。
（3）運動量過少同樣使肥胖性脂肪肝難以糾正。目前孩子的吃得太好，但體力勞動和運動量過少。加上孩子學習負擔越來越重，擠不出時間去接受更多的戶外鍛鍊。更加上父母望子成龍，課外聘請外教、學音樂、外語、奧數、美術……業餘的運動無法安排。近幾年兒童多酷愛上網，加上打遊戲機，看電視，坐得太多太長。身體發胖後更多的脂肪擠進了肝臟，當脂肪沉積於皮下時表現爲肥胖，當脂肪積存於肝臟時，就表現爲脂肪肝。我國近年流行病調查已發現：重度肥胖的兒童中脂肪肝的發病概率竟高達80%。
有些專家還認爲社會心理因素對脂肪肝有影響。兒童心理緊張和過重的功課壓力有意無意使兒童拼命吃零食或偏食動物肉類，不吃蔬菜。長此以往，就會助長肥胖和脂肪肝的發生，這些兒童成長中的社會、家庭和心理因素不消除，用藥物減肥消脂是無法阻斷上述多因素之間的惡性循環的。
近年醫學界還發現：人體肥胖與否，主要取決於機體脂肪細胞的數量和體積。而脂肪細胞的數量，又主要取決於母親孕後3個月，生後一年及11~13歲三個階段的生長積累。如果孩子在這三個關鍵時期體內的脂肪細胞超量生長，過後任你想盡辦法減肥，也只能讓脂肪細胞的體積略有縮小，數量上不會有任何變化，一旦停止減肥，這羣餓“瘦”了的脂肪細胞會很快恢復原貌，這就是兒童肥胖很難糾正的基本原因所在。
對兒童肥胖症的治療有別於成人肥胖，治療上困難較多。根本原因是：兒童還在生長髮育，他們仍需要熱能和各種營養素來維持身高的生長。任何治療措施都不應妨礙兒童正常的生長髮育。因此對成人可使用的手術去脂，束胃法，藥物減肥，飢餓療法，禁食等措施都不宜對兒童使用。此外，短期快速減肥在兒童期也是不提倡的。孩子從正常體重長成肥胖，一般要經過數月或數年，在此過程中，身體的各個器官，如心、肺、腎臟等，已經逐漸適應了高體重的狀況。短期快速減肥（每月體重下降在5千克以上），一般減去的只是身體內的水分（體液）；人體體液的快速丟失，使心肺和腎臟等器官一時難以適應，容易出現水電解質混亂和循環系統的問題並導致腎功能損害，甚至會增加成年後心血管疾病潛在的危險因素。另一方面，以人體水分丟失爲主要方式的減肥效果，難以持久，一旦減肥措施停止，體重會迅速恢復到原有水平。體重的大起大落，不僅對身體健康有害，且容易使肥胖兒童對治療肥胖失去信心。另外，快速減肥者，即使肝內脂肪沉積可以消退，但卻可誘發和加劇肝組織內炎症和纖維化，導致脂肪組織動員入肝反饋性增多，並刺激胰島素分泌增加，誘導體脂轉移至肝細胞內，更易繼發脂肪肝、膽石症、高血壓、糖尿病、痛風等代謝性疾病的增加。並且，初期階段減肥速度越快者，體重反跳的概率也越大，維持正常體重也會越困難。因此，經驗和教訓早就告訴我們：兒童肥胖症減肥，醫患人員和家長千萬不要操之過急。