1.總三碘甲腺原氨酸(TT3) 正常參考值：0.45~1.37 ng/ml
TT3是甲狀腺激素對各種靶器官作用的主要激素。
血清TT3濃度反映甲狀腺對周邊組織的功能優於反映甲狀腺分泌狀態。
TT3是查明早期甲亢、監控複發性甲亢的重要指標。
TT3測定也可用於T3型甲亢的查明和假性甲狀腺毒症的診斷。增高↑：
甲亢，高TBG血癥，醫源性甲亢，甲亢治療中及甲減早期TT3呈相對性增高；碘缺乏性甲狀腺腫病人的TT4可降低，但TT3正常，亦呈相對性升高；T3型甲亢，部分甲亢患者TT4濃度正常，TSH降低，TT3明顯增高。
降低↓：
甲減，低T3綜合徵(見於各種嚴重感染，慢性心、腎、肝、肺功能衰竭，慢性消耗性疾病等)，低TBG血癥等。
2.總甲狀腺素(TT4) 正常參考值：4.5~12 ug/dl
TT4是甲狀腺分泌的主要產物，也是構成下丘腦-垂體前葉-甲狀腺調節系統完整性不可缺少的成份。
TT4測定可用於甲亢、原發性和繼發性甲減的診斷以及TSH抑制治療的監測。增高↑：
甲亢，高TBG血癥(妊娠，口服雌激素及口服避孕藥，家族性)，急性甲狀腺炎，亞急性甲狀腺炎，急性肝炎，肥胖症，應用甲狀腺激素時，進食富含甲狀腺激素的甲狀腺組織等。
降低↓：
甲減，低TBG血癥(腎病綜合徵，慢性肝病，蛋白丟失性腸病，遺傳性低TBG血癥等)，全垂體功能減退症，下丘腦洌劇烈活動等。
3.遊離三碘甲腺原氨酸(FT3)/遊離甲狀腺素(FT4)
正常參考值：FT3 1.45~3.48 pg/ml FT4 0.71~1.85 ng/dl
FT3、FT4是T3、T4的生理活性形式，是甲狀腺代謝狀態的真實反映，FT3、FT4比T3、T4更靈敏，更有意義。
FT3、FT4測定的優點是不受其結合蛋白質濃度和結合特性變化的影響，因此不需要另外測定結合參數。FT3含量對鑑別診斷甲狀腺功能是否正常、亢進或低下有重要意義，對甲亢的診斷很敏感，是診斷T3型甲亢的特異性指標。FT4測定是臨牀常規診斷的重要部分，可作爲甲狀腺抑制治療的監測手段。
當懷疑甲狀腺功能紊亂時，FT4和TSH常常一起測定。TSH、FT3和FT4三項聯檢，常用以確認甲亢或甲低，以及追蹤療效。5.促甲狀腺激素(TSH) 正常參考值：0.49~4.67 mIU/L
TSH檢測是查明甲狀腺功能的初篩試驗。
遊離甲狀腺濃度的微浠就會帶來TSH濃度向反方向的顯著調整。
因此，TSH是測試甲狀腺功能的非常敏感的特異性參數，特別適合於早期檢測或排除下丘腦-垂體-甲狀腺中樞調節環路的功能紊亂。分泌TSH的垂體瘤的患者血清TSH升高，TSH是甲狀腺癌術後或放療以後採用甲狀腺素抑制治療監測的重要指標。增高↑：
原發性甲減，異位TSH分泌綜合徵(異位TSH瘤)，垂體TSH瘤，亞急性甲狀腺炎恢復期。
降低↓：
繼發性甲減，第三性(下丘腦性)甲減，甲亢CTSH瘤所致者例外，EDTA抗凝血者的測得值偏低。6.抗甲狀腺球蛋白抗體A-TG (Anti-TG，TGA) 正常參考值：0~34 IU/ml
甲狀腺球蛋白(TBG)是一種潛在的自身抗原，當進入血液後可刺激機體產生TGA。
TGA是甲狀腺疾病中首先發現的自身抗體，具有高度種屬特異性，是診斷自身免疫甲狀腺疾病(AITD)常用指標。在自身免疫性甲狀腺炎患者中可發現TGA濃度升高，出現頻率大約是70-80%。
Graves病TGA的陽性率約爲60%，經治療後滴度下降提示治療有效，如果滴度持續較高，易發展成粘液性水腫。
甲亢病人測得TGA陽性且滴度較高，提示抗甲狀腺藥物治療效果不佳，且停藥後易復發。
甲狀腺癌與TGA呈一定的相關性，陽性率可達13%-65%，TGA值的升高是腫瘤惡化的一種標誌。
7.抗甲狀腺微粒體抗體A-TM(Anti-TM，TMA) 正常參考值：0~50 IU/ml
TMA是由自身免疫甲狀腺疾病所引起的自身抗體之一，和TGA一樣已公認是甲狀腺自身免疫過程中的重要標誌，是最具代表性的抗體，對自身免疫性甲狀腺疾病的診斷上，是不可或缺的指標，是除組織學診斷自身免疫性甲狀腺疾病的特定手段之一。在自身免疫性甲狀腺炎(即Graves病)時，血清TGA和TMA顯著高於正常人及其他非自身免疫性甲狀腺疾病，對鑑別診斷自身免疫性甲狀腺炎有重要價值，二者聯合應用其診斷符合率可達98%。橋本氏甲狀腺炎、原發性甲減及甲亢等免疫性疾病患者血清TMA和TGA顯著高於正常人，尤其橋本氏甲狀腺炎更爲突出，血清TMA和TGA是診斷此類疾病的特異指標。①甲亢：
TGA、TMA均強陽性，TMA高於TGA，兩種抗體均低於橋本氏甲狀腺炎。
部分患者治療後TGA、TMA可轉爲陰性，但多數臨牀治癒的甲亢患者TGA、TMA長期測定弱陽性。
因此應定期複查甲狀腺功能，以防復發。②橋本氏甲狀腺炎、阿狄森氏病：
TGA、TMA均表現強陽性，亦有少部分患者TMA強陽性，TGA弱陽性或陰性。
亞甲炎患者兩種抗體明顯高於正常人，低於橋本氏甲狀腺炎。③原發性甲低症：
TGA、TMA均陽性，但繼發性甲低TGA、TMA陰性，用以鑑別繼發性甲低。④甲狀腺癌：
TGA增高明顯。⑤孕期自身免疫疾病：
TGA、TMA均可增高。
8.抗甲狀腺過氧化物酶抗體A-TPO(Anti-TPO，TPOA)
TPOA是主要的甲狀腺組織自身抗體，是甲狀腺激素合成過程的關鍵酶，與甲狀腺組織免疫性損傷密切相關。
主要包括甲狀腺刺激性抗體(TS-Ab)和甲狀腺刺激阻滯性抗體(TSB-Ab)。TPOA直接對抗甲狀腺過氧化物酶(TPO)，TPO在生物合成T3和T4過程中催化甲狀腺球蛋白酪氨酸的碘化，近來的研究證實TPO是甲狀腺微粒體抗原的主要成分，TPOA是TMA的活性成分，因此存在於患者體內的TPOA就是TMA。TPOA與自身免疫性甲狀腺疾病(A ITD)的發生、發展密切相關，可通過細胞介導和抗體依賴的細胞毒作用使甲狀腺激素分泌不足造成自身免疫相關的甲減，作爲自身免疫性甲狀腺疾病的診斷和監測指標，TPOA比TMA具有更好的靈敏度、特異性、更可靠和有意義，已成爲診斷甲狀腺自身免疫性疾病的首選指標。
TPOA的主要臨牀應用：
診斷橋本氏病(HD)和自身免疫性甲亢；毒性彌慢性甲狀腺腫(Graves)；監測免疫治療效果；檢測家族甲狀腺疾病的發病可能；預測孕婦產後甲狀腺功能障礙的發生。對原發性甲減患者，結合TSH升高，可以發現早期甲減病人。
對可疑甲減患者，若TPOA升高，有助於原發和繼發甲減的鑑別。
HT患者，TPOA終生存在，如臨牀表現典型且TPOA持續高水平，可作爲診斷依據確診。
TPOAb：在自身免疫性甲狀腺疾病(AITD)中普遍存在。臨牀上主要用於監測免疫治療的效果，查明有甲狀腺疾病家族史的人的患病可能性以及預測孕婦產後甲狀腺機能障礙的發生。低水平的TPOAb在無症狀的患者中約佔10%，提示爲AITD的易感人羣。因此，在大多數AITD的診斷中，TPOAb具有較高的臨牀價值。目前，高特異性與高靈敏度的TPOAb檢測已成爲診斷與治療AITD首選的檢測自身抗體的方法。研究發現在初診的GD患者中，TPOAb的陽性率爲96% 許多學者在臨牀實踐中也發現甲狀腺自身抗體對甲狀腺疾病的初診患者的檢測不但具有診斷上的意義，而且對指導治療和預測免疫緩解也有非常重要的意義。