雖然說男性因雖然不多見，但是因手淫導致的性功能障礙也是引發男性性功能障礙的不可忽視的原因之一。少數手淫的男性會因此而導致陽痿、早泄、不射精，也有極少數出現逆行射精，從而使妻子不能受孕，這些情況多數是由於長期的嚴重手淫習慣，造成性心理障礙所致。
陽痿的原因是由於病人習慣了手淫的強刺激，從而對性交沒有慾望，不能勃起。由於陰莖不是在大腦皮質的性刺激（如視覺、聲音、氣味、接吻或觸摸等）下，而是依靠局部的直接刺激才能勃起，並且在停止刺激的情況下很快變得不堅，此時如果強行插入，往往容易出現早泄。
男性不射精是由於陰*裏的抽動達不到手淫的刺激強度，無法達到射精閾值。而逆行射精則是由於精神心理的紊亂，射精時輸精管出現逆蠕動，使精液逆行排入膀胱。對於手淫過度引發的性功能障礙，必須及時到正規的男科醫院進行治療，給病人實施心理指導，可採用性感集中治療法，必要時進行藥物輔助治療。
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