1 抗病毒治療無關緊要
由於75%的乙肝病毒攜帶者終生不發病，這使得一些應該接受治療的慢性乙型肝炎患者誤認爲抗病毒治療無關緊要，肝功能異常時服用一些降酶藥物就行了。這些患者長期不願就醫，也不願配合醫生的系統治療，甚至放棄定期的肝功能和病毒學指標的監測，一旦病情嚴重而不得不就醫時，往往已經發展爲重型肝炎或肝硬化晚期。
的確，有些乙肝病毒攜帶者可終生不發病。但乙肝病毒對人體的損害常常是在體內靜悄悄地進行，多數慢性肝炎患者在轉氨酶輕度升高時並無明顯症狀。因此，我們常說乙肝病毒是體內潛伏的“特務”，乙肝病毒感染者應該隨時保持警惕，建議半年到醫院檢查肝功能和乙肝病毒DNA、兩對半，一旦發現異常，應立即就醫，根據醫生的治療方案進行抗病毒治療。
2 盲目相信一些廣告
一些乙肝患者爲了治療疾病，盲目相信一些廣告。有一位肝功能正常的乙肝“小三陽”患者，盲目聽信廣告，花了近兩萬元錢，不但沒有使乙肝病毒清除，還因藥物中毒導致了藥物性腎損害。還有一些患者看到一則抗乙肝藥物在轉基因鼠上試驗的報道，就認爲這種藥物一定能治好乙型肝炎。
一種有效的抗病毒藥物都要按照國際上統一的GCP標準，經過臨牀前（動物）、Ⅰ期（健康人和少數病人）、Ⅱ期和Ⅲ期（國際多中心、雙盲對照）的臨牀研究才能正式上市，有些藥物還要經過Ⅳ期臨牀研究。在這些試驗中，不僅要觀察藥物的有效性，還要觀察其安全性。這一過程，至少要經過2～3年。在這些試驗結束前，誰也不能斷定其在臨牀上肯定有效和安全。
3 沒有適應症隨便用藥
乙型肝炎的抗病毒藥物屬於處方藥，其最佳適應症是HBVDNA大於10000陽性、ALT反覆波動在100～300單位的慢性活動性肝炎病人。另外，一些肝硬化患者，要進行肝、腎移植術的乙肝感染者，腫瘤化療期和圍手術期的乙肝感染者也可使用。但目前常看到一些肝功能正常的患者爲了達到清除乙肝病毒的目的而自行購藥治療，儘管在治療的初期可以達到HBVDNA陰轉的結果，但停藥後仍會再次升高，結果導致病毒發生耐藥，甚至在患者真正需要抗病毒治療時，無法選擇有效的治療藥物。
另外，由於一些新的核苷類抗病毒藥物對胎兒的影響尚不完全清楚，在妊娠早期不應使用。干擾素對甲狀腺功能有一定的影響，對血象也有抑制作用，有甲狀腺疾患和白細胞較低的乙肝患者也應慎用。患者自行購藥治療是十分錯誤和危險的。
4 不能堅持抗病毒治療
一些患者在進行抗病毒治療時今天服藥，明天不服，或者想起來就服，忘記了就停藥；還有一些患者在治療後剛剛達到HBVDNA陰轉的初步療效就誤認爲病毒已被清除，可以停藥了。這樣的治療不僅起不到對乙肝病毒的抑制作用，而且還可能加速耐藥的發生，甚至使病毒的複製反彈，導致肝病加重。這是因爲目前一些抗乙肝病毒藥物的主要作用是抑制乙肝病毒的複製。服藥時，乙肝病毒的複製減弱或停止了；停藥後，乙肝病毒會重新活躍。因此，一定要堅持按時服藥和長期治療，達到一個持續抑制病毒的效果，才能取得較好的療效。
5 治療期間不進行監測
抗乙肝病毒的藥物是否達到了效果，是否產生了耐藥，主要依靠治療期間的監測。如果治療3個月以上，患者的HBVDNA滴度未見下降，說明這種抗病毒藥物治療無效，就應該更換其他抗病毒藥物治療；如果達到療效，可繼續治療一段時間後停藥；如果用藥期間出現HBVDNA和ALT的反跳，可能是因爲病毒發生了變異，對藥物產生了耐藥。
另外，有些抗病毒藥物在治療期間可能會發生一些不良反應，這些不良反應都需要在治療中定期檢查才能及時發現。
6 過分恐懼病毒變異
一些患者的HBVDNA滴度很高，肝功能長期異常，但由於他們過分恐懼病毒變異而不敢使用抗病毒藥物治療。這會使病毒在體內不斷複製，肝細胞壞死持續存在，肝功能長期異常，其結果將會刺激肝臟內大量纖維組織增生來修復肝臟內的壞死竈，導致肝硬化；或由於增生過度，導致肝腫瘤。
其實病毒變異是很正常的事。因爲人類要用藥物去抑制病毒的生長，而病毒本身也要去適應環境以便生存。例如流感病毒，每年都在發生變異，因此人們每年都要製造出新的疫苗進行預防接種。細菌也會發生變異。使用青黴素治療一段時間，細菌就對青黴素產生了耐藥，這就是細菌發生了變異的結果。乙肝病毒也是這樣，長時間使用一種抗病毒藥物，病毒就會發生變異，並對這種藥物產生耐藥。一旦病毒對一種藥物耐藥後，可再選用其他藥物繼續治療。如果積極治療，使病毒很快受到抑制，肝細胞壞死停止，肝功能好轉，就阻止了肝纖維化的進展，爲進一步的治療或等待更有效的藥物出現贏得了時間。
7 “小三陽”患者不用治療
一般來說，乙肝病毒感染的“小三陽”狀態是乙肝病毒複製的“冬眠期”。這時，乙肝病毒幾乎無複製，肝功能正常，病人的病情相對平穩，無須治療。但部分“小三陽”患者反覆肝功能異常，其原因可能是感染了一種前C區變異的乙肝病毒。患者常伴有持續性或間歇性血清轉氨酶升高，導致進行性肝病。因此，這樣的“小三陽”乙肝患者仍需要抗病毒治療。另外DNA大於10000的小三陽患者，肝功正常的可以考慮調節免疫治療，長期高病毒也可能發展肝硬化肝癌。
8 肝硬化患者抗病毒爲時已晚
有些乙肝患者的病情已經發展爲肝硬化，甚至出現了腹水、消化道出血、肝昏迷等肝功能失代償的表現。這些患者常對治療失去信心，認爲抗病毒治療爲時已晚。
其實，近年上市的新一代核苷類抗乙肝病毒藥物不僅能緩解肝硬化患者的病情，而且還很安全。近年來，國內外醫生對乙肝肝硬化患者抗病毒治療的研究均取得了較大的進展並積累了一定的經驗。在國外的一項研究中，一些準備接受肝移植的失代償期肝硬化患者，在手術前接受了抗乙肝病毒的藥物治療，治療後，有2／3的患者肝功能明顯好轉，甚至收到了暫緩手術的效果。
9 盲目聯合抗病毒治療
一些患者爲了達到清除乙肝病毒的目的，盲目聯合多種抗乙肝病毒的藥物。其實，一些藥物的作用機制是相同的。另有一些藥物，儘管他們的作用機制不同，但經過近幾年的臨牀研究，多數專家並沒有看到聯合用藥比單一用藥有更好的效果。另外，乙肝病毒也不像艾滋病病毒的抗藥性那麼強，必須在多種藥物聯合使用的所謂雞尾酒療法下才能抑制病毒複製。乙肝病毒對抗病毒藥物十分敏感，應用新一代核苷類藥物，80％以上的患者在小劑量下就能達到抑制乙肝病毒複製的目的。因此近年來多數專家認爲，乙肝的抗病毒治療藥物不應盲目聯合應用，而應採用一種抗病毒藥物使用一段時間後再更換另一種藥物的序貫治療方法。
10 對抗病毒治療期望值過高
由於一些乙肝病毒感染者在社會上受到一定的歧視，造成他們迫切追求所謂轉陰治療，並對乙肝的抗病毒藥物期望值過高。在抗病毒治療期間，不去注意肝功能改善和乙肝病毒DNA的抑制，而一味期望乙肝病毒表面抗原陰轉。其實，目前的乙肝抗病毒藥物僅能起到抑制乙肝病毒複製的作用，並不能把乙肝病毒從體內完全清除。抗病毒治療的目的是抑制乙肝病毒的複製，改善肝臟功能，緩解肝細胞的病理損害。要堅持持久的治療，使乙肝病毒長期處於抑制狀況，最終達到HBVDNA陰轉，肝功能恢復，e抗原陰轉，並出現e抗體的病毒“冬眠”狀況，使肝細胞得到保護。