使用緊急避孕藥物後可能發生下面這些副作用：
(1)噁心：不同的藥物發生率不同，其中米非司酮最低，爲6％—7％。噁心一般持續不超過24小時。
(2)嘔吐：不同的藥物發生率不同，左炔諾孕酮約5％，米非司酮約1％。通常認爲，與食物同時服用或睡覺前服藥可以減少噁心、嘔吐的發生率，但無確切的臨牀資料。
(3)不規則子宮出血：有些婦女用藥後會有陰道點滴出血，一般無需處理。
(4)月經改變：多數婦女月經會按時來潮，也有一部分婦女月經提前或延遲。如果月經延遲1周，應該做尿妊娠試驗，以明確是否是緊急避孕失敗。
(5)其他：乳房脹痛、頭痛、頭暈、乏力等，這些症狀一般較輕微，持續時間不超過24小時。乳房脹痛、頭痛嚴重者可用阿司匹林或其他止痛藥對症處理。
服用緊急避孕藥的注意事項：
(1)緊急避孕藥只能對前一次性生活有事後避孕作用，服藥後不能再有無防護措施的性交。
(2)服藥後有少量陰道出血不是避孕成功的標誌，如果沒有月經量樣出血，應及早到醫院檢查。
(3)服藥後1小時內發生嘔吐，應儘快補服1次。
(4)緊急避孕藥只能偶爾使用，不能代替常規避孕方法。
(5)已經妊娠的婦女禁用緊急避孕藥，因爲緊急避孕藥對已經確立的妊娠是沒有流產作用的。
(6)無保護措施的性生活後，服藥越早，防止非意願妊娠的效果越好。