長效避孕藥的副作用仍然讓很多女性望而生畏。在使用過目前市場上最常見的長效避孕藥後，不少女性都抱怨藥物讓她們產生了類早孕反應，如噁心、嘔吐等，還有人產生了過敏反應、月經失調、白帶增多及血壓升高等問題。
已經生育過的女性，很多都面臨着長期避孕的問題。不少人覺得，天天吃避孕藥或者使用安全套很麻煩，所以傾向於使用長效避孕藥。
但長效避孕藥的副作用仍然讓很多女性望而生畏。在使用過目前市場上最常見的長效避孕藥後，不少女性都抱怨藥物讓她們產生了類早孕反應，如噁心、嘔吐等，還有人產生了過敏反應、月經失調、白帶增多及血壓升高等問題。一旦停藥，則完全恢復正常。
從化學成分來說，長效避孕藥與短效避孕藥類似，可分爲雌激素、孕激素及雌孕合劑三種。
如果有女性對它的副作用敏感，那麼其副作用也應與同成分的短效避孕藥相同。需要注意的是，由於長效藥物需要一次性放入體內，量比較大，停藥後可能有一定的蓄積。所以在一般情況下，建議沒有生育過的婦女最好不要服用長效避孕藥。如果服藥後想生孩子，應當停藥3個月至半年。
使用長效避孕藥時，應該定期去醫院體檢，包括乳腺、肝功能、血壓和宮頸刮片，發現異常者應停藥。
哺乳婦女至少要生產6個月以後才能開始應用，不哺乳婦女產後至少6個星期纔可以使用。