新生兒便祕的治療方法：在嬰兒護理中儘可能地母乳餵養，因爲母乳餵養的嬰兒發生便祕的可能性較少。如果寶寶發生便祕，可喂加糖的菜水或果汁等。
1、中藥治療：清熱解毒，潤腸通便的中藥可以適當應用(需有醫生的指導)。
2、添加輔食時，便祕的治療：可以吃菜泥、水果、玉米粉、麥片等。平時要多給寶寶喝一些溫開水，溫潤腸道。
3、適當地按摩腹部：按摩左下腹，如果觸及條索狀物，輕輕地由上而下地按摩，促使大便下行排出。
4、適當地按摩小兒肛門口：這能引起生理反射，促進排便。
5、適當地活動，促進大便下移，引起排便。
6、人工通便：用石蠟油、開塞露、小的肥皂條等通便同時訓練排便習慣(僅限於便祕嚴重時使用)。
便祕是寶寶常見病，那麼新生兒便祕到底是什麼原因：
1、外科性疾病：可能的畸形包括腸道閉鎖、腸狹窄、腸旋轉不良、先天性巨結腸、先天性無肛、骶尾部脊柱裂、脊膜膨出、腫瘤壓迫馬尾部神經等，這些疾病常伴有嚴重的嘔吐和腹脹的現象，需及時診治。
2、人工餵養：牛奶經消化所含的皁鈣較多，易引起大便乾結，從而便祕。
3、乳量不足：如果吃奶吃得少，或嘔吐較多，或進食補液的小兒可引起暫時性的無大便。另外，新生兒的消化道肌層發育尚不完全，這樣易引起便祕，還可同時伴有吐奶。只要小兒體重不下降，嘔吐和便祕的現象都是正常的。