肛管直腸瘻主要侵犯肛管，很少涉及直腸，故常稱爲肛瘻，是與會陰區皮膚相通的肉芽腫性管道，內口多位於齒線附近，外口位於肛周、皮膚處。整個瘻管壁由增厚的纖維組織組成，內復一層肉芽組織，經久不愈，發病率僅次於痔，多見於男性青壯年，可能與男性的性激素靶器官之一的皮脂腺分泌旺盛有關。
肛瘻的症狀
肛瘻常有肛周膿腫自行潰破或切開排膿的病史，此後傷口經久不愈，成爲肛瘻外口。主要症狀是反覆自外口流出少量膿液，污染內褲;有時膿液刺激肛周皮膚，有瘙癢感。若外口暫時封閉，膿液積存，局部呈紅腫，則有脹痛，封閉的外口可再穿破，或在附近穿破形成另一新外口，如此反覆發作，可形成多個外口，相互溝通。如瘻管引流通暢，則局部無疼痛，僅有輕微發脹不適，病人常不介意。
目前多按肛管與括約肌的關係將肛瘻分爲4類。
1、括約肌間肛瘻
多爲低位肛瘻，最常見，約佔70%，爲肛管周圍膿腫的後果。瘻管只穿過內括約肌，外口常只有一個距肛緣較近，約3～5cm少數瘻管向上，在直腸環肌和縱肌之間形成盲端或穿入直腸形成高位括約肌間瘻。
2、經括約肌肛瘻
可以爲低位或高位肛瘻，約佔25%爲坐骨直腸窩膿腫的後果。瘻管穿過內括約肌、外括約肌淺部和深部之間，外口常有數個，並有支管互相溝通。外口距肛緣較近，約5cm左右，少數瘻管向上穿過肛提肌到直腸旁結締組織內，形成骨盆直腸瘻。
3、括約肌上肛瘻
爲高位肛瘻，少見，佔5%。瘻管向上穿過肛提肌，然後向下至坐骨直腸窩穿透皮膚。由於瘻管常累及肛管直腸環，故治療較困難，常需分期手術。
4、括約肌外肛瘻
最少見，佔1%，爲骨盆直腸膿腫合併坐骨直腸窩膿腫的後果。瘻管穿過肛提肌直接與直腸相通。這種肛瘻常由於克隆病、腸癌或外傷所致，治療要注意其原發病竈。以上分類在高低位方面較細緻，有利於手術方法的選擇。
如肛管左右側均有外口，應考慮爲“蹄鐵型”肛瘻。這是一種特殊型的貫通括約肌肛瘻，也是一種高位彎型肛瘻，瘻管圍繞肛管，由一側坐骨直腸窩通到對側，成爲半環型，如蹄鐵狀故名。在齒線附近有一內口，而外口數目可多個，分散在肛門左右兩側，其中有許多支管，向周圍蔓延。蹄鐵型肛瘻又分爲前蹄鐵型和後蹄鐵型兩種。後者多見，因肛管後部組織比前部疏鬆，感染容易蔓延。
檢查：外口呈乳頭狀突起或肉芽組織的隆起，壓之有少量膿液流出，低位肛瘻常只有一個外口，若瘻管位置較淺，可在皮下摸到一硬索條，自外口通向肛管。高位肛瘻位置常較深，不易摸到瘻管，但外口常有多個。由於分泌物的刺激，肛周皮膚常增厚及發紅。