要想對於脂肪肝進行確切的診斷，就要嚴格把握三個重點，這三個重點分別爲分析患者的病史、臨牀表現和實驗室檢查等，這些是對於脂肪肝進行診斷的主要依據；特別是B超和CT，但確切的診斷還是有賴於肝活檢。
①病史：脂肪肝無特異性症狀。約半數患者可無明顯自覺症狀，部分患者有易疲勞、食慾降低、腹脹、肝區不適或隱痛、噁心、暖氣等。患者可能有長期飲酒史或有糖尿病，肥胖、營養不良及中毒性肝損傷等病史。部分患者可觸及肝腫大，並可有輕度壓痛。
②實驗室檢查：可有血漿球蛋白變化，特別是α1、α2及 β脂蛋白增高，血清GGT、ALT、AST活性輕度增高或正常。但這些均爲非特異性的變化。
③B超和CT檢查：脂肪肝B超檢查可見肝實質呈微細緻密的強反射光點，深部組織回升減弱。超聲對重度脂肪肝的診斷率達95％。CT掃描示肝臟密度比其他臟器（如正常脾臟、血管）低下，一般認爲其準確性優於B超。
④肝活檢：獲取肝組織進行組織觀察，可對脂肪肝作出確診。