目前較成熟的方法是，內鏡下乳膜切除術和預防性手術。內鏡下大腸息肉摘除術是預防大腸癌發病的最重要的治療手段二早期大腸癌也可以經內鏡（超聲內鏡）檢查十染色＋病理確診以後做內鏡下乳膜切除（ endoscoPicn : ucoal resection , EMR ）。在每 3 一 5 年例行的大腸鏡檢查或對大腸癌高危人羣追蹤隨訪發現，大腸息肉最爲常見。其次是早期大腸癌的發現。這些癌前疾病和早期癌的內鏡下切除，極爲有效。這在家族性息肉病、潰瘍性結腸炎和散發性大腸癌的患者本人，及其家族成員中的效果非常明顯。對於一些體積過大，如直徑＞ 3cm 、基底廣、內鏡下無法切除，或分次切割失敗的息肉，或癌前疾病，則可能需要進行剖腹手術切除病變腸段：從本質來講，癌前疾病和癌前病變的內鏡下豁膜切除，或手術切除，屬於預防性手術。但是，其意義與治療性手術兩者相比，至少相等。因此，其重要性怎麼強調都不過分。
普通大腸息肉的內鏡下治療比較簡單。內鏡醫師根據不同的息肉形態、體積及其分型，採取電灼、電凝和切割。對於山田 I 型和 n 型基底較廣不易套住者．可以採用雙孔道內鏡，同時在息肉基底部注射腎上腺素生理鹽水（ l ’ 10 000 ) ，使息肉局部隆起，然後便可以比較方便地應用圈套器和活檢鉗（或三爪鉗）抓起、套住，再通電切下。採用這樣的方法切下自、肉以後，局部形成的創面較大。可能有較多出血。此時，可以向局部噴灑止血藥物，如去甲腎上腺素生理鹽水（ 1 ’ 10 000 ）或凝血酶等。對於有稍大血管出血，則可以經內鏡下用金屬止血夾止血或氫氣電熱燒灼：大腸息肉內鏡治療以後，需要禁食觀察 l 一 3 天。患者出院以後，一般還需要複查腸鏡。複查的時間間隔可以根據不同患者而定。一般不超過兩年。
早期大腸癌也可以應用相似的內鏡下勃膜切除術，但是診斷方法不同。首先，發現病竈以後，需要進行內鏡下染色，並且將病竈在放大內鏡圖像條件下仔細觀察表面形態。接着，對病竈進行超聲內鏡檢查，確足病竈侵犯的腸壁層次。早期大腸癌的病竈累及豁膜層或勃膜下層。超聲內鏡可以非常清楚地將腸壁顯示爲 5 層或更多層的結構。當然，對病變部位做活檢是必不可少的。病理組織學檢查可以準確確定腫瘤病變的組織細胞類型。
早期大腸癌確診以後，一般應用雙孔內鏡進行內鏡下豁膜切除術。切除過程與上述寬基底的山田 I 型和 11 型大腸息肉的 EMR 相似，要求不同的是務必保證將病竈一併全部切除。爲此，切除前需要將病竈染色，以確定病變範圍。接着在病竈基底部注射腎上腺素生理鹽水（ 1 : 10 000 ) ，其切除的隆起的範圍要超出病竈周邊 Zmm 以上。根據病竈範圍的大小，如果估計一次不能全部切下，則將病竈分成兩等分三等分，再分次切下。如果估計切除以後：留下的創面太大，則可以分兩次做 EMR 。間隔的時間一般在 1 周左右。
EMR 治療的主要併發症是出血和穿孔。 EMR 術後患者一般都需要禁食 2 一 3 天。如患者無出血和穿孔表現，則可以在開放飲食的一二天後出院如發生出血，經臥牀、止血處理後仍不止，處理上一般先做內鏡治療。處理方法在上文已經述及，一般不需要手術治療。如果發生穿孔，只要穿孔範圍小也可以先進行內鏡治療。方法可以採用金屬止血夾將穿孔部位籍住閉合。仍然無效或失敗時，再考慮進行外科手術治療。早期大腸癌施行 EMR 治療時，應當將切下的腫瘤組織全部回收，進行病理組織學檢查，以明確切緣有無腫瘤組織存在。內鏡治療完畢，患者應該嚴格列人隨訪計劃，進行跟蹤隨訪複查。複查的手段主要是全結腸鏡檢查。一般是第一年 3 次。分別於 EMR 以後的 1 個月、 4 個月、 11 一 12 個月做內鏡檢查。檢查時應當在原先 EMR 部位相當於早期癌切除部位的邊緣至少做 3 個點的活檢，並送病理檢查。如切除未淨，可以再次做 EMR ，並重新制訂和執行隨訪計劃。