細菌感染引起肛門直腸周圍膿腫的主要症狀是：起初發現肛門直腸周圍有一個小硬塊或腫塊;繼而局部突然出現劇烈疼痛難以忍受、紅腫發熱、墜脹不適、坐臥不寧、裏急後重、大便祕結、排尿不暢，有直腸刺激症狀，並隨之出現如體溫升高、食慾不振、寒戰、神疲乏力等全身中毒症狀。一般1 周左右即可形成膿腫。膿腫形成後在肛門周圍或直腸指診可以觸到波動、柔軟的膿腔。此時用注射器穿刺可抽出膿液。如行切開排膿處理，或自潰流膿後，局部疼痛、發熱等症狀就會緩解或消失，體溫下降，全身情況改善。
結核性的臨牀表現常常是慢性起病，膿腫經數週或數月才能形成，局部疼痛不劇烈，常伴有低熱。破潰後流出的膿液呈清稀乳白色，膿口凹陷，常有多個流膿的外口，經久不愈。全身檢查可找到結核病竈，膿液培養可發現結核桿菌。
深部膿腫一旦形成後，若延誤了膿腫的早期手術治療，那麼感染竈就很可能波及周圍附近間隙，形成範圍更大的膿腫。膿液可從皮下蔓延到坐骨直腸窩，從患側經組織間隙蔓延到健側，又可經內外括約肌之間進入肛門內，向上穿破提肛肌進入盆腔形成腹膜炎;或向鄰近組織器官如直腸、膀胱、陰道、尿道等侵蝕，形成複雜性肛瘻。
所以在膿腫形成後，一定要及時處理，否則，不僅是給患者增加了身體上的痛苦，而且將對人體造成嚴重的危害。
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