首先，內分泌變化，這點在女性患者非常顯著。有些女性每逢經期或行經前後就會出現口腔潰瘍，用藥治療只能暫時緩解，下月行經時依然如故地出現，疼痛難忍，與此同時，還常伴有口乾、心煩、易怒和大便乾結等令人煩惱的症狀。這主要是由於體內黃體酮水平增高而雌激素(孕酮等)的水平降低所致。因此，女性在此期間需保持愉快的心情，注重勞逸結合，堅持按療程服藥，避免過度疲憊，飲食要清淡，多吃水果、新鮮蔬菜。治療過程中，以不吃辛、辣、發味類食品爲上策。
其次，精神因素也是口腔潰瘍的原因之一：有的患者在精神緊張、情緒波動、睡眠狀況不佳的情況下發病，可能與植物神經功能失調有關。對此，應常用淡鹽水漱口，戒除菸酒，生活起居保持規律，保證充足的睡眠，堅持體育鍛煉，飲食清淡。
再次，遺傳因素：如父母雙方均患有複發性口腔潰瘍時，其子女約有80— 90%患病，若雙親之一患此病時，其子女約有50—60%患病。
最後，如果缺乏微量元素鋅、鐵、葉酸、維生素B12等，降低了機體免疫功能，也會增加複發性口腔潰瘍發病的可能性。