肛管直腸瘻主要侵犯肛管很少涉及直腸，故常稱爲肛瘻，是與會陰區皮膚相通的肉芽腫性管道內口多位於齒線附近，外口位於肛周、皮膚處整個瘻管壁由增厚的纖維組織組成，內復一層肉芽組織，經久不愈發病率僅次於痔，多見於男性青壯年，可能與男性的性激素靶器官之一的皮脂腺分泌旺盛有關。
肛瘻自然癒合的幾乎很少，手術是主要療法，常能獲得痊癒，但有一定的複發率。不適合手術的病例，可用非手術療法，一般能減輕症狀，防止瘻管向縱深蔓延，控制其發展。肛瘻和肛旁膿腫一樣，不同於身體其他部位的感染，由於發生在肛門直腸附近，在肛門或直腸內有一固定感染來源，即內口，同時病竈位於肛門括約肌內，括約肌的舒張和收縮會影響膿液的排出。
因此說，肛瘻和肛旁膿腫一旦發生，不論輕重，多沒有自愈的可能，藥物治療也只是減輕症狀，臨牀只有通過手術治療才能達到治癒目的。以往曾有許多人試圖用手術以外的多種方法治療，但都以失敗告終，至少可以說，到目前爲止還未發現非手術方法能治癒肛瘻的。
推薦首選治肛瘻技術—HCPT微創術
HCPT微創術是美國的一個相對來說比較先進的技術。HCPT微創術治療肛裂，利用高頻電容場產熱原理，通過直腸纖維鏡進入到肛門裏面，通過監視器，直接對肛管裂口進行微創電凝，使肛管裂口乾結閉合。
治療肛瘻的方法分傳統療法和HCPT微創術兩種。其中傳統療法多采用擴肛法、注射療法、切除法等，擴肛法雖然操作簡便，不需特殊器械，護理簡單，但卻存在使用不當可併發血腫、出血、肛周膿腫、痔脫垂及短時間大便失禁的劣勢。注射療法需嚴格控制壞死範圍，以免損傷健康組織。切除法一般需要住院20-30天，且患者的疼痛時間長。
HCPT微創術治療肛瘻則有效規避了傳統療法的劣勢，不僅如此，微創療法以手術時間短，複發率極低贏得了患者和醫學人士的普遍認可。經臨牀驗證HCPT微創術治療肛瘻對有較好療效，且具有無痛、無需住院、且手術時間短的優勢，是至今最好的治療肛裂的方法。