女性性交疼痛的最主要及明顯的症狀即爲性生活時出現的不同程度、不同性質的疼痛，也是患者就診的主要原因。
1.疼痛的性質及部位 先天性生殖器發育異常，如處女膜肥厚，處女膜傘、陰道閉鎖、狹窄或短小、陰道縱隔或橫隔，疼痛爲表淺性鈍性撞擊痛，常伴有陰道插入困難;陰脣及陰道口粘連、瘢痕、外陰炎、前庭大腺炎、囊腫等常爲局部燒灼樣痛、銳痛或撞擊時的疼痛;陰蒂或陰蒂包皮過敏時，疼痛呈牽拉性或接觸性疼痛。肛門直腸疾病時，疼痛常呈瀰漫性;陰道感染性疾病或陰道創傷及陰道萎縮時，由於缺乏雌激素等因素引起陰道、子宮頸內黏液的酸鹼度改變，疼痛多在陰道口、陰道內，呈銳痛或輕度疼痛。子宮後傾或伴有子宮肌瘤，表現爲月經前期深部性交疼痛。子宮內膜異位常致經前期性交疼痛，隨性交動作而深部疼痛。慢性盆腔炎等盆腔病變時多爲深部性交痛，而膀胱炎時常有隨性交動作的陰道前壁性交痛;脂肪膨出也可引起性交時陰道前壁的疼痛。外陰皮膚由於性傳播的皰疹性外生殖器炎症，性交時可引起陰道外部或內部灼痛;尖銳溼疣引起性交時外陰或陰道口燒灼樣疼痛;其他如單純皰疹、帶狀皰疹、陰蝨、疥瘡、皮炎等都可引起性交淺部疼痛。
2.相伴的器質性疾病症狀 如子宮內膜異位症，有典型的經期下腹部疼痛病史，疼痛呈進行性加重，盆腔檢查時常有陰道後穹隆觸痛、子宮或附件的壓痛、宮頸的舉痛、搖擺痛等，有時可觸及內膜異位形成的巧克力囊腫;先天性無陰道、陰道短小或狹窄、陰道隔膜、處女膜閉鎖或肥厚等，婦科檢查時即可明確診斷;各種原因導致的外生殖器萎縮，有陰道乾澀、外陰瘙癢、白帶少，多有尿頻、尿急、尿痛等泌尿道感染症狀;檢查時見外陰陰道皮膚、黏膜變薄，缺乏彈性，陰道分泌物減少或性狀發生改變，常有反覆發作的泌尿生殖道感染史;外陰陰道炎症包括螺旋體類性傳播疾病(STDs)時，常有白帶異常、外陰瘙癢，婦檢見局部充血、紅腫潰破及STDs典型的外陰皰疹或贅生物增生等病理損害;分娩、哺乳或絕經特殊生理事件的存在等其他疾病如精神病等的典型表現。
3.精神情緒表現 患者可能述說“不想過性生活，只是盡做妻子的義務”、“害怕或討厭房事”、“丈夫只顧自己的感受，動作又粗魯、又不好對他說”、“就是說也說不清楚，有時還被誤會爲故意找理由躲避性生活”等類似的抱怨，消極對待夫妻性生活;患者情緒或低落、煩躁，或激動、敏感;夫妻關係不和諧，心理壓力大;一般不主動談及性生活問題，但經詢問可發現可能因性知識及性經驗的不足或缺乏存在的性功能障礙隱患;有些患者在婦檢時不由自主地出現緊張焦慮、軀體後移、雙腿內收或用手阻擋窺陰器或手的觸碰而抗拒檢查。
性交疼痛通常伴有明確的婦科疾病，因此醫師要詳細詢問病史及各種社會心理相關因素，瞭解疼痛的起因、部位、持續時間及併發症狀等。要詳細進行婦科檢查，含窺器檢查、陰道檢查和必要的三合診檢查，只有除外婦科及全身器質性相關疾病後，才能考慮社會心理因素。