男性不育在不孕不育中佔有大概40%的比例。男性不育是由多種病因導致的,男性生殖器包括內外生殖器和性腺軸不同水平的異常最終表現爲生育力下降或喪失的綜合病症。正因爲如此，男性不育的治療與其他系統疾病不同，對於男性不育症不可能用一種特效的藥物或方法治療各種不同病因所致的男性不育症。相反由於目前還未能認清全部男性不育的病因因此也就尚無肯定有效的治療方法用於臨牀。
目前，在臨牀有一定療效的男性不育的治療方法有:【】
免疫治療:應用外科手術切除生殖管道局部的損傷病竈減少抗男性精子抗體的產生同時使用免疫製劑可取得較好療效。
外科治療:近年應用顯微外科技術治療男性生殖系疾病是男性不育診治技術的主要進展。現已廣泛用於臨牀的有:輸精管的顯微外科吻合術、附睾管與輸精管的顯微外科吻合術。
人工授精:應用各種物理和生物化學技術處理精液提高男性精子受孕能力進行夫精人工授精(AIH)。應用精液冷藏技術對無男性精子症患者給予供精人工授精(AID)但實際應用中對於供精者的選擇等尚有許多複雜問題。
內分泌治療:主要應用長效庚酸睾酮治療促性腺激素低下的性腺功能低下症;溴隱亭治療高泌乳素血癥;克羅米芬治療少男性精子症以及HCG和HMG合用治療促性腺激素低下症。
生殖道炎症的治療:目前主張聯合應用抗生素與抗炎類藥物治療的效果較好。
原因不明的不育症的治療:目前除了已經明確了病因而且有一定治療方法的男性不育症外 尚有許多原因不明診斷不明確的少男性精子症和弱男性精子症統稱爲原因不明的男性不育症。此種情況的治療方法繁多但療效均不肯定男性不育的治療歸納有:激素、抗生素、甲狀腺素、維生素、微量元素、氨基酸等藥物以及中草藥治療同時輔以勸告病人避免菸酒防止精神緊張、過度疲勞以及保持正常營養和規律的生活習慣等。
不孕不育不僅是男性的問題，也有可能是女性的問題，因此，專家建議夫妻雙方一起到醫院做個準確的檢查。
男性不育治療成功病例：
患者張先生，男，30歲，湖南長沙人。結婚8年未孕，於2009年2月來院就診，平時也身體一直較好，性生活和諧，因此，認爲男方是沒有問題的。但他妻子的婦科檢查做完沒有問題後，醫生建議男方再行精液檢查：灰白色，量3.5ml，黏稠度（++），液化時間1.5小時，活動力一般，活動率45%，精子數348萬/ml，白細胞（+）。結論：精子偏少，精液過於黏稠、難以液化而導致的男性不育症。診斷：原發不育症（弱精、少精）。
治療：經中、西藥抗感染治療，結合一些相應的物理療法兩個療程後，男方精液檢查：灰白色，量3.5ml，黏稠度（—），液化時間30分鐘，活動率65%，精子數1150萬/ml。2007年6月，張先生的妻子被證實懷孕，圓上一個孕育之夢。
長沙是湖南一家高起點、高標準、高品質、不孕不育技術力量雄厚、不孕不育醫療設備先進的專業治療男性不孕不育症的醫院。率先成立不孕不育診療中心，由臨牀經驗豐富的中西醫權威專家組成，結合現代醫學的科研成果，針對內分泌失調、免疫因素引起的少精、弱精、無精性不育症和先天發育異常、性功能障礙等原因引起的男性不育症有獨特方法。科學的採用個性化的診療方案，對其進行全方位多層次的系統治療。目前已成功開展睾丸活檢術、附睾穿刺術、輸精管探查術、鞘膜積液切除術、精索靜脈曲張高位扎節術的技術，幫助數千個不孕不育家庭圓了做父母的心願。