尿液中含有多種酸鹼性化學物質，當病人局部神經內分泌失調，引起後尿道壓力過高、前列腺管開口處損傷時，就會造成尿酸等刺激性化學物質返流進入前列腺內，誘發慢性前列腺炎。病原微生物感染各種微生物如細菌、原蟲、真菌、病毒等都可成爲致前列腺炎的感染源，其中又以細菌爲最常見，如淋球菌、非淋球菌等。細菌的侵入途徑主要有三種。一是血行感染，臨牀上發現，細菌性前列腺炎90%以上是由於微生物感染所致。二是淋巴感染，比如下尿路感染和結腸、直腸的炎症可通過淋巴管道而感染前列腺，產生炎症。三是直接蔓延，男性排尿時，尿液要經過前列腺，尿中的細菌可直接進入前列腺，從而導致前列腺感染。
焦慮、抑鬱、恐懼
專家發現，50%的慢性非細菌性前列腺炎病人有焦慮、抑鬱、恐懼、悲觀等過度緊張的症狀。而伴有疼痛及神經衰弱的前列腺病人常常過於誇大軀體的不適和疼痛，自覺症狀往往大於實際病情，這種情況被稱爲“緊張型前列腺炎”。而心理因素又與年齡的大小有關，年輕患者精神負擔明顯重於年齡大的患者，這種情況往往直接影響到藥物治療的效果。
研究表明，慢性前列腺炎與自身免疫因素有一定關係。有專家曾在一些關節炎病人的身上發現“抗前列腺抗體”的存在。這類病人往往是因先天或後天免疫缺陷而產生抗前列腺抗體，從而導致前列腺組織損傷。如果患者經過檢查沒有發現細菌、病毒、支原體感染的證據，可考慮免疫性因素的存在。