1.含漱液
含漱液，具有消炎殺菌的作用，可以消滅引起潰瘍的細菌抑制細菌的滋生，這類藥物對於外物損傷(例如，牙齒、筷子等)口腔黏膜病的情況比較適用，但是對於其他原因引起的口腔潰瘍不會有很大的作用。
2.意可貼
意可貼的主要成分是醋酸地塞米松(一種皮質激素)，可減輕炎症反應，幫助破損潰瘍面癒合。但是這種治療往往只針對潰瘍面，對於各種“上火”、病毒引起的口腔潰瘍，無法進行徹底根除，而激素的存在給人體帶來的副作用也是不能忽視的。
3.複合維生素B
很多口腔潰瘍都是由於缺乏維生素A或維生素B2、B6有關，爲了快速補充這些成分，可以通過服用維生素片來提高。但是使用該方法時，一定要確定是因缺乏此類元素導致的，而對於其他原因的潰瘍，是不會有作用的。
4.牛黃解毒片
如果潰瘍表面呈黃色、紅腫熱痛，且伴有口苦口臭、心煩身熱、尿黃、便祕症狀的患者可服用，中醫認爲這屬於“實火”導致的潰瘍。但是中藥治療往往要結合患者體質、病情來用藥。而自服藥物，往往在劑量上很難把握。
5.六味地黃丸
六味地黃丸，是一種常見的治療“虛火”引起口腔潰瘍的藥物。和上面提到的“實火”潰瘍要加以區分，如果一旦用錯藥物，不僅對治療潰瘍沒有效果，還有可能助長病情。
6.冰硼散、西瓜霜
這兩類藥物，是大家經常用到的藥物。但是應當指出的是和含漱液等藥物一樣，往往只針對潰瘍面來治療，忽視了也不可能深入病竈進行徹底治療。所以對於輕型口腔潰瘍患者可以採用，而嚴重口腔潰瘍患者一定不要因爲這些藥物耽誤治療。