丙肝併發症常見併發症有關節炎（12%～27%），腎小球腎炎（26.5%），結節性多動脈炎等。少見的併發症有糖尿病、脂肪肝、再生障礙性貧血、多發性神經炎、胸膜炎、心肌炎及心包炎等，其中尤以糖尿病和脂肪肝值得重視。少數患者可後遺肝炎後高膽紅素血癥。
預防對獻血員進行抗HCV篩查，嚴格掌握輸血、血漿、血製品的適應症；保證血液及血製品質量，是降低輸血後丙型肝炎的最重要措施。其他措施包括宣傳丙型肝炎防治知識，醫療器械一用一消毒，採用1次性醫療用品；遵守消毒隔離制度等。
治療1.干擾素（interferon，IFN）+利巴韋林治療 持久應答率爲50%左右，到目前爲止，IFN+利巴韋林聯合抗病毒治療仍是公認的治療慢性丙型肝炎的最有效藥物。
一般認爲，HCV感染時間越短，肝組織學病變越輕，血中病毒水平越低則療效越好。因此對急性丙型肝炎，血ALT持續不降者，或慢性丙型肝炎，HCVRNA持續陽性，應考慮IFN抗病毒治療。對於慢性丙型肝炎患者：①血清ALT持續異常；②肝組織學檢查有慢性肝炎特徵；③無創肝纖維化檢查提示明顯肝纖維化者，更應積極抗病毒治療，以免病情進展爲肝硬化喪失抗病毒治療時機。