包皮環切術的醫療補助覆蓋率和其他的挑戰至少屬於美國兒科學會（AAP）1999年的一份胎位報紙的一部分，這份報紙說：儘管存在“潛在的醫學利益”，但這些數據作爲常規的新生兒包皮環切術仍顯不足。
Schoen和其他人，比如哈佛的公共衛生博士、醫學人類學家Daniel Halperin介紹：包皮環切術可預防HIV的傳播的依據從十九世紀八十年代末就已經堅不可摧了。但是AAP聲明瞭最令人信服的研究後，醫療社區至今仍對此表示懷疑。
今年早期，但包皮環切術可幫助預防HIV感染是明顯的事實的時候，隨機選擇肯亞和烏干達男性接受包皮環切術的三項試驗也已停止。接受此項手術的男性大約有一半人可能會感染HIV。Schoen說：“與疫苗有同樣的療效，可使感染率降低50%。”今年三月份當美聯合衆國的世界衛生組織宣佈包皮環切術應該加入能夠幫助預防疾病的清單中的時候，新生兒施行包皮環切術的最後辯護就開始了。
包皮環切術能幫助抵抗AIDS是因爲包皮對HIV的接觸很容易感染。它常因有裂縫被病毒感染。疾病如在沒有行包皮環切的男性中常見的細菌感染梅毒和軟下疳可爲HIV提供一個侵入的入口。
現在APP針對包皮環切術發表了一份最後的聲明，有望於2008年或2009年發佈。
確定的是，包皮環切術有一些危險存在。大約有百分之一的嬰兒有輕微的出血或感染，但這些很容易痊癒。嚴重的錯誤，像切掉陰莖幹，是極少發生的。一旦死亡，1/500000的機率使包皮環切術成爲一種最安全的外科手術。
仍然可以輕易的發現一些無害的網址如circumcision.org.上的包皮環切術的反對者們。 他們的觀點在包皮環切術的好處成爲重點之前佔有比較大的比重。Schoen說：“範圍從心理學到宗教再到道德不等”。
大約有7%的男心雖出生時未行包皮環切術，但最後卻做了這個手術，因爲不能忍受龜頭部包皮的感染和致疼的黏着物。
就像他們說的，選擇是自己的。
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