一、物理性因素
例如：腹部X線透視或攝片，會引起先天性心臟缺陷、小頭畸形、死胎等危險。
由於工作需要長期接觸電腦或手機等具有輻射的工具也會引發胎兒畸形。
二、化學性因素
例如：有毒物質的觸碰可能導致嬰兒的先天性失明和腦積水。
化妝品含有的化學物質，主要是砷、鉛、汞等有毒物質，被孕婦的皮膚和粘膜吸收後，可透過血胎屏障，進入胎血循環，或者是化妝品中的一些成分經陽光中的紫外線照射後產生的有致畸作用的芳香胺類化合物質，都對胎兒的發育產生不良影響。據美國的一項調查表明，每天濃妝豔抹者胎兒畸形的發生率是不塗濃妝者的1.25倍。
工作地點內的污染，如高溫、噪聲、電磁輻射，或者新屋入夥裝修所遺留的污染，如甲醇、苯等有害氣體也會引發父母雙方染色體的變異從而導致無腦兒、“海豹兒”（缺肢無肢貌似海豹的嬰兒）的產生。
三、藥物因素
藥物的誤用濫用也是導致孕婦生育畸形兒可能性的原因之一。
例如：在婦女妊娠3個月內，胚胎處在相繼分化和聯合時期，各系統尚未成熟，解毒功能不具備，所以藥物對胚胎有很大作用。如果孕婦服了某種藥物，藥物就能滲入胎盤，影響胎兒的發育，導致某些部分畸形。一些滋補藥品、維生素和一些中藥對胎兒也有影響。
下面列舉一些孕婦常使用但是又對嬰兒具有負面作用的藥物：
（1）已經臨牀肯定能緻畸的藥物如：
1. 抗癌藥如氨基喋呤、6-巰基嘌呤、5-氟脲嘧啶等；
2. 性激素：會使男胎女性化或女胎男性化，或使女嬰到青春期時發生宮頸癌和陰道癌。
（2）可能會緻畸的藥物如：
1. 維生素：服用過量時會緻畸，如維生素A每日服用5萬單位（相當於濃縮A）丸劑2丸、或濃縮魚肝油滴劑30滴，連續3個月，會使胎兒骨骼畸形、並趾、齶裂、眼與腦畸形、腎及中樞神經損害。
2. 鎮靜藥：安定導致脣裂和齶裂。利眠寧會引起死胎、四肢畸形及發育遲緩。氯丙嗪引起視網膜病變和新生兒抑制。妊娠期間如果睡眠欠安也儘量不要用鎮靜安眠藥。
3. 降血糖藥：甲磺丁脲（D860）、氯磺丙脲、優降糖，在妊娠期間會導致流產、死胎、多發性畸形如先天性心臟病、兔脣、齶裂、骨畸形及血小板下降。妊娠期可用胰島素而避免用降糖藥物。
（3）潛在緻畸或對胎兒有害的藥物如：
抗生素：鏈黴素、卡那黴素及新黴素在妊娠全期都不宜應用，以免使胎兒患先天性聾或內耳前庭損傷而致維持身體平衡發生障礙。磺胺類藥物在妊娠早期會緻畸，妊娠後期會使新生兒患溶血型貧血、高膽紅素血癥和引起核黃疸而驚厥死亡或智力低下。 氯黴素和合黴素在妊娠期會使肝損傷，血小板減少。新生兒期使嬰兒患灰色綜合徵。
四、病毒性因素
例如：孕婦病毒感染也是導致畸形兒的原因之一，常見的是懷孕早期患流感、風疹、鉅細胞病毒、單純皰疹病毒等病毒感染，使胎兒患小頭畸形及腦積水、腦鈣化等組織或器官畸形。
五、遺傳因素
例如：夫妻雙發家庭史中有染色體畸變、基因突變等狀況
近親結婚導致隱性致病基因發生作用
六、生活習性因素
例如：
1.酗酒影響胎兒正常發育，易緻畸。酒精損害生殖細胞，使受精卵質量下降導致胎兒發育不良。酒精也可通過胎盤屏障直接毒害胎兒。
2.吸菸的孕婦分娩嬰兒的畸形率是不吸菸婦女的2-3倍，其中嬰兒患先天性心臟病的比例爲73％，患白血病的危險要高一倍。
3.孕婦接觸帶菌的貓也是一種對導致胎兒畸形威脅很大的傳染病源，而貓的糞便則是這種惡性傳染病傳播的主要途徑。據有關資料顯示，在英國，由於孕婦親近貓給嬰兒造成不良後果的，約佔染病孕婦的40％，每年約有500名嬰兒被貓所害。
4.孕婦活在現代緊張的工作和生活節奏下，中樞神經和內分泌系統受到影響，情緒在其控制下也會出現各種問題。如果不良情緒發生在妊娠期間的前3月，就可能會造成胎兒脣裂或齶裂等畸形。
七、氣候因素
例如：近年來，我國科研人員發現，嬰兒畸形發生率與氣溫呈正相關，氣溫越高，婦女受孕後發生畸形可能性越大。研究人員還發現氣壓高時，嬰兒畸形發生率相對較低，而氣壓低時，嬰兒畸形發生率相對較高。
針對以上各種導致嬰兒畸形的原因，孕婦應當做好以下的措施：
1.注意身體，吸收足夠的營養，養成良好的生活習性
2.萬一生病，也不能亂吃藥，應當在諮詢醫生意見後按照醫囑慎重服藥
3.遠離一切物理、化學、發射性物質
4.選擇適宜的季節受孕，秋高氣爽時節是婦女受孕的最佳時期
5.自覺進行婚前檢查、產前檢查和遺傳諮詢
6.保持良好的心態，做個心情愉悅的準媽媽
少年兒童是祖國的未來，肩負着祖國建設的重任，而前提正是他們健康地成長。
嬰兒畸變率作爲當中的絆腳石，畸變率的下降和畸形嬰兒的治癒等問題的解決刻不容緩。