乳腺增生病病變組織的大體標本爲，病變呈洋溢性或侷限性，質地硬韌而緻密，色黃白或灰白，無包膜，切面可見有多個鉅細不等的半通明顆粒；如爲囊性增生，則可見到小囊腫，囊壁大都光滑，囊內含有黃綠色或棕色的粘稠液體，有的還有顆粒狀物或乳頭狀物向囊腔內凸起。
因爲乳腺增生病的組織形狀複雜，所以其組織學分類辦法也多種多樣。若有學者依乳腺構造在數目和形狀上的異常將其分爲乳腺組織增生、乳腺腺病（又分爲小葉增生期、纖維腺病期及纖維化期）、乳腺囊腫病三大類；也有的學者依乳腺增生的根本組織改動將其分爲小葉增生、纖維化、炎性、囊腫、上皮增生、腺病6品種型。也恰是因爲其組織形狀學上的複雜性，所以才形成了本病定名上的紊亂性，如小葉增生症、慢性乳腺炎、纖維囊性乳腺病、良性上皮增生症、腺病等。
乳腺增生病按導管上皮增生的形狀可將其分爲四級：Ⅰ級：不伴有導管上皮增生，此級發作率爲70%；Ⅱ級：伴有導管上皮增生，但上皮細胞不呈異型性，其發作率爲20%；Ⅲa級：伴有導管上皮增生，上皮細胞呈輕度異型性，發作率爲5%；Ⅲb級：伴有導管上皮增生，上皮細胞呈重度異型性，發作率爲5%，此級惡變率最高，能夠惡變率爲75%～100%。